Meestal wordt de dosering langzaam opgehoogd om bijwerkingen te voorkomen of te beperken. De bijwerkingen zijn o.a. droogheid van de huid en slijmvliezen (lippen), haarverlies, zonovergevoeligheid, verhoging van cholesterol en vet in het bloed, leverfunctiestoornissen, spierpijn en hoofdpijn. Zwangerschap is uitgesloten bij het gebruik van acitretine. Om hier zeker van te zijn, wordt de behandeling op de tweede of de derde dag van de menstruatiecyclus gestart. Acitretine kan wel aan mannen met een kinderwens worden gegeven.
Alcoholmisbruik is een contra indicatie voor het gebruik van acitretine. Verder wordt het gelijktijdige gebruik van bepaalde geneesmiddelen afgeraden. De acitretine capsules worden bij voorkeur tijdens de maaltijd of met volle melk ingenomen.